RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPYSL3	Q14195	570 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	UGP2	Q16851	508 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SARM1	Q6SZW1	724 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	H2AFV	Q71UI9	128 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSKH2	Q96QS6	385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SP110	Q9HB58	689 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENC1	O14682	589 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFSD11	O43934	449 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIAS2	O75928	621 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM253	P0C7T8	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GM2A	P17900	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP12	P39900	470 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RABIF	P47224	123 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACADVL	P49748	655 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH6	P55285	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMG2	Q02383	582 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALGDS	Q12967	914 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRM3	Q14832	879 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROX2	Q3B8N5	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	INAVA	Q3KP66	663 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAF2	Q96CS3	445 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF599	Q96NL3	588 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPT3	Q9UH03	358 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	KNTC1	P50748	2209 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEMP1	O14524	444 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TM7SF2	O76062	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTA2	O94776	668 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAN1A1	P33908	653 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUOX	P51687	545 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN6	P56747	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGCG	Q13326	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	IHH	Q14623	411 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PQLC3	Q8N755	202 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPOCK2	Q92563	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MGME1	Q9BQP7	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014		U3KQA8	63 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FPGT	O14772	594 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIGLEC6	O43699	453 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT37	O76014	449 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP3K6	O95382	1288 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSF2	P04141	144 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6	P13671	934 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINA4	P29622	427 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJC1	P36383	396 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCNN1B	P51168	640 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP1S1	P61966	158 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAMK2B	Q13554	666 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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