RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504788.5

LMNB1-208, Transcript of lamin B1, human

TSL 2

Gene LMNB1, Length 1,801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNB1-208	ENST00000504788	TTI1	O43156	1089 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	RAD51C	O43502	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	LAT	O43561	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PGLS	O95336	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	IGSF6	O95976	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	EPO	P01588	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	TRBC1	P01850	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	UGT2B4	P06133	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	C5AR1	P21730	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ITGB7	P26010	798 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ACSL1	P33121	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CD86	P42081	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CHRNA4	P43681	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ATP5O	P48047	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CXCL12	P48061	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	SCNN1B	P51168	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PTK6	Q13882	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	FGL2	Q14314	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	AGER	Q15109	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	UGP2	Q16851	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CPT1B	Q92523	772 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ARHGAP33	O14559	1287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	AURKA	O14965	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	HR	O43593	1189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	AP1G1	O43747	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	AP2A1	O95782	977 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	IL1B	P01584	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PRNP	P04156	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	SP9	P0CG40	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ADRB3	P13945	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CES1	P23141	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MMP12	P39900	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	NNMT	P40261	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MAPK8	P45983	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ADPRH	P54922	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	WNT3A	P56704	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MPP3	Q13368	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF235	Q14590	738 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	GRM3	Q14832	879 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	E2F5	Q15329	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	QPCT	Q16769	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	JAML	Q86YT9	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMNB1-208	ENST00000504788	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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