RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 WBP2Q969T9 261 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 IFT43Q96FT9 208 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PSKH2Q96QS6 385 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 WWP1Q9H0M0 922 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SEPT3Q9UH03 358 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MSRAQ9UJ68 235 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MID2Q9UJV3 735 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TLK1Q9UKI8 766 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LCHNA4D1U4 455 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TEX28O15482 410 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SLC7A4O43246 635 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LDB2O43679 373 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ITM2AO43736 263 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MGRN1O60291 552 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LILRB3O75022 631 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 GJB3O75712 270 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HAUS5O94927 633 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 OLFM2O95897 454 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 F11P03951 625 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CA3P07451 260 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RHOCP08134 193 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 IRF1P10914 325 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 OXCT1P55809 520 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RAB10P61026 200 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ACVR1Q04771 509 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LAMB3Q13751 1172 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ITIH5Q86UX2 942 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RDH11Q8TC12 318 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SORT1Q99523 831 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PBX4Q9BYU1 374 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 IL21Q9HBE4 155 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 STK39Q9UEW8 545 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HAO1Q9UJM8 370 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CBX6O95503 412 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 KITP10721 976 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 STMN1P16949 149 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CR2P20023 1033 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 GLDCP23378 1020 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 NUMBP49757 651 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RASSF2P50749 326 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 POU4F1Q01851 419 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CREMQ03060 361 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB16Q05516 673 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ITGA9Q13797 1035 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 FIBCD1Q8N539 461 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TRIB3Q96RU7 358 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZBP1Q9H171 429 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ACOT9Q9Y305 439 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM13O60858 407 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 NDST3O95803 873 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 KRT16P08779 473 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SBK3P0C264 359 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SAT1P21673 171 aa8.25□□□□□ -1.09
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