RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MPP1	Q00013	466 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CREM	Q03060	361 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DLG1	Q12959	904 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RIPK1	Q13546	671 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	GRM3	Q14832	879 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	AGER	Q15109	404 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01559	Q495D7	138 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TPGS2	Q68CL5	300 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CES5A	Q6NT32	575 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CASC4	Q6P4E1	433 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	LONP2	Q86WA8	852 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PGBD5	Q8N414	524 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM13C	Q8NE31	585 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF398	Q8TD17	642 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	IGSF8	Q969P0	613 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	WBP2	Q969T9	261 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MTBP	Q96DY7	904 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	C7orf26	Q96N11	449 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	HAPLN3	Q96S86	360 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RBBP8	Q99708	897 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FICD	Q9BVA6	458 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	KIFC1	Q9BW19	673 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	S1PR5	Q9H228	398 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	GLOD4	Q9HC38	313 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DPP7	Q9UHL4	492 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CD207	Q9UJ71	328 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CDH22	Q9UJ99	828 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SCML2	Q9UQR0	700 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		5.88	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM92A	A1XBS5	289 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR11	A4FU01	709 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730		J3KR12	359 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	AURKA	O14965	403 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MATN3	O15232	486 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	BIRC5	O15392	142 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL16	O15467	120 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MBTPS2	O43462	519 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TBX10	O75333	385 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DCTN3	O75935	186 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	USP1	O94782	785 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	C8A	P07357	584 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	KIT	P10721	976 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	GP5	P40197	560 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDH1A3	P47895	512 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CPA2	P48052	419 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NUMB	P49757	651 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TUB	P50607	506 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNQ1	P51787	676 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	LIMK2	P53671	638 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPY1	Q01534	308 aa		5.87	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms