RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 TEKT5Q96M29 485 aa5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 LGMNQ99538 433 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 IL12RB2Q99665 862 aa5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 CENPHQ9H3R5 247 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 HIPK3Q9H422 1215 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 NMUR1Q9HB89 426 aa5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 BANF1O75531 89 aa5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 TUBP50607 506 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 RABGGTBP53611 331 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 TEX44Q53QW1 395 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 RTP2Q5QGT7 225 aa5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 PALM2Q8IXS6 379 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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ATG4A-208ENST00000489247 TRABDQ9H4I3 376 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 CWH43Q9H720 699 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 CASS4Q9NQ75 786 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 STK39Q9UEW8 545 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4A-208ENST00000489247 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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