RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF599Q96NL3 588 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PEBP4Q96S96 227 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM7Q9C029 511 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZWILCHQ9H900 591 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PDFQ9HBH1 243 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PQ67 120 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TSPAN11A1L157 253 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FAM149AA5PLN7 773 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 H3BRJ5 948 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 K7ESM1 405 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MYO1FO00160 1098 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SPINT1O43278 529 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CYP1A2P05177 515 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TPM3P06753 285 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GP1BAP07359 652 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 JUNDP17535 347 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ITIH2P19823 946 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SERPINA4P29622 427 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 THOP1P52888 689 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 BCL2L1Q07817 233 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DPYSQ14117 519 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RTP5Q14D33 572 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC14Q15048 493 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AGERQ15109 404 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NFKBIBQ15653 356 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DPYSL2Q16555 572 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CFAP58Q5T655 872 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ERAP2Q6P179 960 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NETO2Q8NC67 525 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MDM1Q8TC05 714 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TEKT4Q8WW24 435 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GLMNQ92990 594 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 APOLD1Q96LR9 279 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TBATAQ96M53 351 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PSKH2Q96QS6 385 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SP110Q9HB58 689 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SPASTQ9UBP0 616 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SEPT3Q9UH03 358 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GGT7Q9UJ14 662 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ITM2BQ9Y287 266 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 A0A087X0T9 212 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DFFAO00273 331 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FFAR2O15552 330 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AQP9O43315 295 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PIGNO95427 931 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MT-CO3P00414 261 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FAM228BP0C875 321 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RARAP10276 462 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AMPD1P23109 780 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IL1R2P27930 398 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HTR1BP28222 390 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IGFALSP35858 605 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RPIAP49247 311 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SCNN1BP51168 640 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 BLKP51451 505 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AP1S1P61966 158 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PPARDQ03181 441 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms