RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 NT5MQ9NPB1 228 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 TLR4O00206 839 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 MATN3O15232 486 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 PJA2O43164 708 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 SH3BP5O60239 455 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 MMP20O60882 483 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF883P0CG24 379 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 AKT2P31751 481 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 CDKN2BP42772 138 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 DYNLT1P63172 113 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 BCL2L1Q07817 233 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 SHBQ15464 509 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 UGP2Q16851 508 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 CFAP58Q5T655 872 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 DAAM2Q86T65 1068 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 OR13H1Q8NG92 308 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 HDAC11Q96DB2 347 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 TSGA13Q96PP4 275 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 NOD2Q9HC29 1040 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1B0GTQ1 180 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 HLA-DQB2P05538 268 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 THEGLP0DJG4 465 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 KRT10P13645 584 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 CCNCP24863 283 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 MMP12P39900 470 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 CCT8P50990 548 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 FAM193AP78312 1265 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ADCY2Q08462 1091 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 TRAF2Q12933 501 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 SLC14A1Q13336 389 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 IHHQ14623 411 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 TAZQ16635 292 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 KIAA1328Q86T90 577 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 IQCHQ86VS3 1027 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 NAXDQ8IW45 347 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 BBS5Q8N3I7 341 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 SKA1Q96BD8 255 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 BMFQ96LC9 184 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 OLFM3Q96PB7 478 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 LGMNQ99538 433 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 GDF3Q9NR23 364 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 POM121BA6NF01 834 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 KCNK1O00180 336 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 MX2P20592 715 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 DSC2Q02487 901 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ELP6Q0PNE2 266 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 RALGDSQ12967 914 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ZBTB17Q13105 803 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ODF2Q5BJF6 829 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 KAZNQ674X7 775 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC13Q8IYE1 715 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 CCNYQ8ND76 341 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-202ENST00000370287 FATE1Q969F0 183 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms