RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PCNAP12004 261 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SRD5A1P18405 259 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MCM7P33993 719 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SHMT1P34896 483 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CXCR3P49682 368 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLCN3P51790 818 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GALCP54803 685 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC12A2P55011 1212 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PMPCAQ10713 525 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PROSER3Q2NL68 480 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPATS1Q496A3 300 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HECTD3Q5T447 861 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PMS2CLQ68D20 193 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF627Q7L945 461 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NOXA1Q86UR1 476 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GPATCH11Q8N954 259 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MAP4K1Q92918 833 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SARAFQ96BY9 339 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF341Q9BYN7 854 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLK15Q9H2R5 256 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C5AR2Q9P296 337 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A0U1RQF3 1178 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A8MXE2 369 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLK8O60259 260 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KRT4P19013 534 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GPD1P21695 349 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PON1P27169 355 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PIK3CAP42336 1068 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LMAN1P49257 510 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLCN5P51795 746 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RAD23AP54725 363 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LCTLQ6UWM7 567 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SERPINA11Q86U17 422 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMC8Q8IU68 726 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GJC3Q8NFK1 279 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM68Q96MH6 324 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DECR2Q9NUI1 292 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A096LPK6 155 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A1W2PPE2 198 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A1W2PR64 198 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM170AA1A519 330 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DPPA5A6NC42 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RHODO00212 210 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADAMDEC1O15204 470 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VDRP11473 427 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM11P17152 192 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AGAP20933 346 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BMP5P22003 454 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EPHB2P29323 1055 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC16A2P36021 539 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GPR12P47775 334 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 STAT2P52630 851 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KRT83P78385 493 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSF1Q00613 529 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms