RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLBP06746 335 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXCR3P49682 368 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR1H2P55055 460 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN2P57739 230 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLE2Q04725 743 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDR1Q08345 913 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC39A14Q15043 492 aa3.2□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.2□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 A3GALT2U3KPV4 340 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE10A6NGK3 116 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTA2O94776 668 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFB4O95168 129 aa3.19□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGADQ13349 1161 aa3.19□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 VEPH1Q14D04 833 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF11Q15544 211 aa3.19□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF354CQ86Y25 554 aa3.19□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT9BO14905 357 aa3.18□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGT5P36269 586 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNTA1Q13424 505 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRM2BQ7LG56 351 aa3.18□□□□□ -1.9
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