RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQH9 124 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CCL16O15467 120 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MLYCDO95822 493 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 HTR1BP28222 390 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 DGUOKQ16854 277 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CEP44Q9C0F1 390 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 VAV3Q9UKW4 847 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 VPS4AQ9UN37 437 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ULK1O75385 1050 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SLC28A1O00337 649 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 EPHB6O15197 1021 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 CYP4F2P78329 520 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 EVX2Q03828 476 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CYP4F3Q08477 520 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A12O75746 678 aa22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PLK2Q9NYY3 685 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TMCO1Q9UM00 188 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 CNTNAP1P78357 1384 aa22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 CDC42P60953 191 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LPIN1Q14693 890 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 FLCNQ8NFG4 579 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 RAB23Q9ULC3 237 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A24Q6NUK1 477 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 OR4L1Q8NH43 312 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SNPHO15079 494 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ERCC2P18074 760 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R40P59535 323 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP4Q13115 394 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PSMG1O95456 288 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 HGFP14210 728 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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