RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326427.10

ITM2C-202, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-202ENST00000326427 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CLCN5P51795 746 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SEPT6Q14141 434 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SQLEQ14534 574 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 MAPRE2Q15555 327 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF280DQ6N043 979 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 KDELC1Q6UW63 502 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 AHI1Q8N157 1196 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CALML6Q8TD86 181 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 TOP1MTQ969P6 601 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 RANBP9Q96S59 729 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 OSER1Q9NX31 292 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 PLK2Q9NYY3 685 aa22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 HEATR9A2RTY3 570 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 KCNA5P22460 613 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 INHBCP55103 352 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 PSME3P61289 254 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 GALNT7Q86SF2 657 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 C8BP07358 591 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 WNT3AP56704 352 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 STX5Q13190 355 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 LSAMPQ13449 338 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CASP10Q92851 521 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 FNIP2Q9P278 1114 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 DSEQ9UL01 958 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 PCNTO95613 3336 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 WASH4PA8MWX3 477 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 E9PAM4 449 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 M0QZQ0 153 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 RBP1P09455 135 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 C1QTNF8P60827 252 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CREB5Q02930 508 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 LRP8Q14114 963 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CUZD1Q86UP6 607 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 NDNQ99608 321 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 PEX11BO96011 259 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 BRCC3P46736 316 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 ACAP2Q15057 778 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CCL14Q16627 93 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 USP41Q3LFD5 358 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 KLC3Q6P597 504 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SPATA24Q86W54 205 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM209Q96SK2 561 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-202ENST00000326427 TNFRSF10BO14763 440 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TRIM24O15164 1050 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 UBDO15205 165 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TNFAIP8O95379 198 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 PGM3O95394 542 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TFAP2AP05549 437 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 SLC5A3P53794 718 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 INHBEP58166 350 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 FATE1Q969F0 183 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 ADA2Q9NZK5 511 aa22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-202ENST00000326427 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms