RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MTBPQ96DY7 904 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GGT7Q9UJ14 662 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM24O15164 1050 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF1P05230 155 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CES1P23141 567 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 WEE1P30291 646 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCG1P45844 678 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 NEK3P51956 506 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOAP61586 193 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 HYAL1Q12794 435 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LGSNQ5TDP6 509 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RETSATQ6NUM9 610 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GDAP1Q8TB36 358 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF13Q92913 245 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ASIC4Q96FT7 647 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RBBP8Q99708 897 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL5AQ9Y689 179 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GMNCA6NCL1 334 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 AURKAO14965 403 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTFP26441 200 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNFP41002 786 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARSDP51689 593 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRCAPQ14761 206 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRRQ15256 657 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMC3Q5W041 872 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SGSM3Q96HU1 749 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB16Q96NS5 453 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL22O00626 93 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SIN3BO75182 1162 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC12A1Q13621 1099 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GRTP1Q5TC63 336 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM215Q68D42 235 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR149Q86SP6 731 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 APOPT1Q96IL0 206 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MARK1Q9P0L2 795 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FZD6O60353 706 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ALADP13716 330 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ETV4P43268 484 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LIMK2P53671 638 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CTBP1Q13363 440 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CNPY4Q8N129 248 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MYLIPQ8WY64 445 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TIFAQ96CG3 184 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 OTUB2Q96DC9 234 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GGA2Q9UJY4 613 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TPP1O14773 563 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 AHSGP02765 367 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SRCP12931 536 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXN2P32314 431 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC8A1P32418 973 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ACVR1Q04771 509 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SRLQ86TD4 932 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 NAT16Q8N8M0 369 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms