RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 OAZ3Q9UMX2 235 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCK1P16333 377 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 STMN1P16949 149 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB10P61026 200 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNK2Q07912 1038 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADRM1Q16186 407 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 STRADAQ7RTN6 431 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP22Q9UPT9 525 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SBF1O95248 1867 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF487B1APH4 448 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 H3BMQ9 156 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARNTP27540 789 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CUZD1Q86UP6 607 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 COG8Q96MW5 612 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CROTQ9UKG9 612 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SGCDQ92629 289 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADI1Q9BV57 179 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD300AQ9UGN4 299 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NME4O00746 187 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 HBP1O60381 514 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PMPCBO75439 489 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNH1O95259 989 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 FUCA1P04066 466 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SETSIPP0DME0 302 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT1A1P22309 533 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT1A4P22310 534 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT1A3P35503 534 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT1A5P35504 534 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP3K7CLP57077 242 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 GNA12Q03113 381 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 FUNDC1Q8IVP5 155 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 OLFM1Q99784 485 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 GBA3Q9H227 469 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CORINQ9Y5Q5 1042 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ESRRGP62508 458 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB39AQ14964 217 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 TGFBIQ15582 683 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 TANKQ92844 425 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 K7EPI3 171 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 DFFAO00273 331 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNMDO75829 334 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNC1P48547 511 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 STX5Q13190 355 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF19Q2TAC6 998 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSTM1Q86WC4 334 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 LZICQ8WZA0 190 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX25Q9H3E2 840 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 EI24O14681 340 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NRP2O60462 931 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 FYNP06241 537 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 BDNFP23560 247 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADRA1BP35368 520 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERO1BQ86YB8 467 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 FICDQ9BVA6 458 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOS2P35228 1153 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 GJA5P36382 358 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PFKPQ01813 784 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAF2Q12933 501 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCSK7Q16549 785 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms