RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zdhhc7Q91WU6 308 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf111Q99ML9 989 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm8Q9CXT6 414 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mkrn2osD3Z393 217 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Daw1D3Z7A5 415 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifit3bE9PV48 403 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srp72F8VQC1 671 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pot1bH7BX60 640 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oaz1P54369 227 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OsbpQ3B7Z2 805 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HexdcQ3U4H6 486 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Icam5Q60625 917 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx17Q8BVL3 470 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgef33Q8BW86 850 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stx5Q8K1E0 355 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgpl1Q8R0X7 568 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rem2Q8VEL9 341 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnft1Q9DCN7 395 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkl2Q9QUK0 568 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bmp15Q9Z0L4 392 aa16.19■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IsxA1A546 240 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp651E9PZ11 729 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm2832F7AEC7 200 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FynP39688 537 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Man1a1P45700 655 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn5P54830 541 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itga4Q00651 1039 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plcl1Q3USB7 1096 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlx3Q64205 287 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sytl5Q80T23 753 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb8bQ8CII0 484 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsg1Q8R1W2 324 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chrnb2Q9ERK7 501 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3752A6NAT4 150 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap3d1O54774 1199 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt1P04104 637 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep295nlQ497N6 533 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scn2bQ56A07 215 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Senp5Q6NXL6 749 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amigo1Q80ZD8 492 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt75Q8BGZ7 551 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppa2Q91VM9 330 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c50Q91X77 490 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atpaf2Q91YY4 289 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4756A0A140LIS8 335 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brcc3P46737 291 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec4fP70194 548 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifi47Q61635 420 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hspa1aQ61696 641 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tpd52Q62393 224 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tada2aQ8CHV6 443 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf7l2Q924A0 459 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smim11aQ99J19 55 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gfra4Q9JJT2 260 aa16.18■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mup13L7N222 235 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctbp1O88712 441 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3gat3P58158 335 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gstt1Q64471 240 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Best2Q8BGM5 508 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Agr3Q8R3W7 165 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Evi2bQ8VD58 444 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dicer1Q8R418 1916 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ClockO08785 855 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ZfaP23607 742 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpep1P31428 410 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Traf6P70196 530 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem207P86045 143 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ntrk1Q3UFB7 799 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb13Q80Y75 316 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf38Q8BI21 518 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp43Q8BUM9 1132 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps50Q8CI71 964 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtg1Q8R2R6 326 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Reep3Q99KK1 254 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nck1Q99M51 377 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neurl2Q9D0S4 285 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcas2Q9D287 225 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hormad1Q9D5T7 392 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dus2Q9D7B1 493 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thap11Q9JJD0 305 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf11Q9QYK7 154 aa16.17■□□□□ 0.18
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms