RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627490.2

PBX1-222, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PBX1, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-222ENST00000627490 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GMPRP36959 345 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ALDH1A3P47895 512 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.854e-10■■■■■ 43.5
PBX1-222ENST00000627490 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PIGGQ5H8A4 983 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 LPCAT4Q643R3 524 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ADAM32Q8TC27 787 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PCED1BQ96HM7 432 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MIOSQ9NXC5 875 aa20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MAP3K13O43283 966 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 HSPA13P48723 471 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ERFP50548 548 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SCNN1GP51170 649 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CHN2P52757 468 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 AQP4P55087 323 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CCDC126Q96EE4 140 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 HAPLN3Q96S86 360 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 IL12RB2Q99665 862 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GLOD4Q9HC38 313 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 RAB26Q9ULW5 256 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ALPK3Q96L96 1907 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 AIM2O14862 343 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 AHSGP02765 367 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CHRNGP07510 517 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 STMN1P16949 149 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TPH1P17752 444 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 NAGLUP54802 743 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PDK3Q15120 406 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 UROC1Q96N76 676 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.36■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TK2O00142 265 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ZMPSTE24O75844 475 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 HOXC13P31276 330 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 POU4F1Q01851 419 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TCTN1Q2MV58 587 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 RASIP1Q5U651 963 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 LSMEM2Q8N112 164 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 VWCEQ96DN2 955 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GPR78Q96P69 363 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 APOL2Q9BQE5 337 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PIDD1Q9HB75 910 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 FNIP2Q9P278 1114 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.35■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MATN3O15232 486 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 HOXA2O43364 376 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 DLX3O60479 287 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CAPNS1P04632 268 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ME2P23368 584 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ABCG1P45844 678 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TUSC3Q13454 348 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ADGRE1Q14246 886 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 FLOT2Q14254 428 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 MAPRE2Q15555 327 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms