RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHKB	Q9Y259	395 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMAP	O00193	183 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAN2B1	O00754	1011 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIGN	O95427	931 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPHX1	P07099	455 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDHA1	P08559	390 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRNA4	P43681	627 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAPK8	P45983	427 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF2	Q12933	501 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIF1A	Q16665	826 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RANBP10	Q6VN20	620 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC25	Q86WR0	208 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLPP6	Q8IY26	295 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNT16	Q9UBV4	365 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMD3	O43242	534 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF40	O75150	1001 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIN3B	O75182	1162 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK18	Q07002	472 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ENPP2	Q13822	863 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSS51	Q4VC12	460 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	BPTF	Q12830	3046 aa		9.25	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	BANF1	O75531	89 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRL	P01236	227 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKCQ	Q04759	706 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAD51	Q06609	339 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL2L1	Q07817	233 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00523	Q86TU6	105 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDIK1L	Q8N165	341 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIX5	Q8N196	739 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFT43	Q96FT9	208 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIB3	Q96RU7	358 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPC1	O15118	1278 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEFTY1	O75610	366 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPO	P01588	193 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	UGT2B4	P06133	528 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTSL	P07711	333 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NTSR1	P30989	418 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGEA3	P43357	314 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARL4C	P56559	192 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GALNT3	Q14435	633 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC1A5	Q15758	541 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC14A2	Q15849	920 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK40	Q8N2I9	435 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FEM1C	Q96JP0	617 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAM23	O75077	832 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPH1	P17752	444 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERPINA4	P29622	427 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRADD	P78560	199 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDH17	Q12864	832 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	BBS9	Q3SYG4	887 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO43	Q4G163	708 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARSI	Q5FYB1	569 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	DENND2C	Q68D51	928 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		9.24	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms