RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A0D9SEW6 157 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 SPINT1O43278 529 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 RAMP2O60895 175 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 TUBB4AP04350 444 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 HLA-FP30511 346 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 ACVRL1P37023 503 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 OPRD1P41143 372 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 SYT13Q7L8C5 426 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 APCDD1Q8J025 514 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 P3H4Q92791 437 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 PNKPQ96T60 521 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 KLC2Q9H0B6 622 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 DONSONQ9NYP3 566 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 DEC1Q9P2X7 70 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 VPS28Q9UK41 221 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD4L-218ENST00000587547 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEDD4L-218ENST00000587547 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.58□□□□□ -1.04
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NEDD4L-218ENST00000587547 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.58□□□□□ -1.04
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NEDD4L-218ENST00000587547 H7C0C1 242 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 CBX4O00257 560 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 SNAP91O60641 907 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 APOC2P02655 101 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 APODP05090 189 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 CISD3P0C7P0 127 aa8.58□□□□□ -1.04
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NEDD4L-218ENST00000587547 PTGER3P43115 390 aa8.58□□□□□ -1.04
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NEDD4L-218ENST00000587547 MESP2Q0VG99 397 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 SNX1Q13596 522 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 GEN1Q17RS7 908 aa8.58□□□□□ -1.04
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NEDD4L-218ENST00000587547 PARP15Q460N3 678 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 FUT11Q495W5 492 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 C4orf17Q53FE4 359 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.58□□□□□ -1.04
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NEDD4L-218ENST00000587547 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 LZTR1Q8N653 840 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 ACTL9Q8TC94 416 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD4L-218ENST00000587547 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.58□□□□□ -1.04
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