RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 RDH11Q8TC12 318 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ELMO1Q92556 727 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MKL1Q969V6 931 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PPM1 405 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM22K7EJ46 135 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 FSCN2O14926 492 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 AADATQ8N5Z0 425 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 RCN3Q96D15 328 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MECRQ9BV79 373 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 BBS12Q6ZW61 710 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 SNX15Q9NRS6 342 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 KIFC1Q9BW19 673 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 CCDC157Q569K6 752 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 DDI2Q5TDH0 399 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 SPESP1Q6UW49 350 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 CDH19Q9H159 772 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 CLUHO75153 1309 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 MZT2AQ6P582 158 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PPP3R2Q96LZ3 170 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC3O15379 428 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HGFP14210 728 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 IL12AP29459 219 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 COPS5Q92905 334 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 QRFPRQ96P65 431 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.48■■□□□ 1.03
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