RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562996.1

AC068987.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC068987.1, Length 427 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068987.1-201ENST00000562996 NOD2Q9HC29 1040 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PARD6AQ9NPB6 346 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SEPT10Q9P0V9 454 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PLXNA2O75051 1894 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 C10orf142B7Z368 130 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ZSCAN12O43309 604 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 NEBLO76041 1014 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 JCHAINP01591 159 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SERPINA4P29622 427 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 MAPK8P45983 427 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 BCL2L1Q07817 233 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ITKQ08881 620 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 GRM3Q14832 879 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 NOMO1Q15155 1222 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 RPS6KA1Q15418 735 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 WDR45BQ5MNZ6 344 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SYCP2LQ5T4T6 812 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ZSWIM9Q86XI8 627 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SYT12Q8IV01 421 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 IL12RB2Q99665 862 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 BRD8Q9H0E9 1235 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SUV39H2Q9H5I1 410 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 GGT7Q9UJ14 662 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PILRBQ9UKJ0 227 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ITM2BQ9Y287 266 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa19.99■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TSPAN11A1L157 253 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 USP27XA6NNY8 438 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PATE3B3GLJ2 98 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SPINT1O43278 529 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 DSC2Q02487 901 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PLA2G2CQ5R387 149 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TCEAL6Q6IPX3 200 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ACTL9Q8TC94 416 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 DNASE2BQ8WZ79 361 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TCEAL3Q969E4 200 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SEMA3CQ99985 751 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TLR10Q9BXR5 811 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PREBQ9HCU5 417 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 DKK3Q9UBP4 350 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 FADS3Q9Y5Q0 445 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ZNF292O60281 2723 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 LAMA1P25391 3075 aa19.98■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 GON4LQ3T8J9 2241 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TJP3O95049 919 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TIMP2P16035 220 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ITIH2P19823 946 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TGM1P22735 817 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 CFAP58Q5T655 872 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SEL1L2Q5TEA6 688 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ALG1LQ6GMV1 187 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 CNTD1Q8N815 330 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ORAI3Q9BRQ5 295 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 EBF2Q9HAK2 575 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SEMA4GQ9NTN9 838 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 AMACRQ9UHK6 382 aa19.97■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 H7C0C1 242 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 KCNK3O14649 394 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 AP1G1O43747 822 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 LRP3O75074 770 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PCDH8O95206 1070 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 PRKCGP05129 697 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ATP5OP48047 213 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 CCR5P51681 352 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TRAF2Q12933 501 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 IHHQ14623 411 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 RALGPS1Q5JS13 557 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 BRAT1Q6PJG6 821 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TTC7BQ86TV6 843 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 TRIM69Q86WT6 500 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.96■□□□□ 0.79
AC068987.1-201ENST00000562996 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms