RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556765.1

TRAPPC6B-206, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC6B, Length 664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLC14A1Q13336 389 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SEMA5AQ13591 1074 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLC29A2Q14542 456 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PDGFRLQ15198 375 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HECTD3Q5T447 861 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NAXDQ8IW45 347 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CPA6Q8N4T0 437 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FRMD1Q8N878 549 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 USP33Q8TEY7 942 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GCNAQ96QF7 691 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 OSER1Q9NX31 292 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PTPRBP23467 1997 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 E9PAM4 449 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM72CH0Y354 149 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ARHGAP33O14559 1287 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SOAT2O75908 522 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RHOQP17081 205 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCNCP24863 283 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CDC25CP30307 473 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CHKAP35790 457 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 AVPR1AP37288 418 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NDST2P52849 883 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 AP1B1Q10567 949 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EFEMP1Q12805 493 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RASA2Q15283 850 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CRY1Q16526 586 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PARP6Q2NL67 630 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 KRT71Q3SY84 523 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 C2orf27AQ580R0 203 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ARMC3Q5W041 872 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM72BQ86X60 149 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCNYQ8ND76 341 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 P2RY11Q96G91 374 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SERPINB12Q96P63 405 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CLMPQ9H6B4 373 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLC12A8A0AV02 714 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 E7EVH7 732 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 I6L893 689 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 AGTP01019 485 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MAPKAPK2P49137 400 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SEC13P55735 322 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CBX1P83916 185 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANO4Q32M45 955 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCDC38Q502W7 563 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EMC10Q5UCC4 262 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCNJLQ8IV13 435 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RIN3Q8TB24 985 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GIPC2Q8TF65 315 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NACA2Q9H009 215 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SIK2Q9H0K1 926 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PRORYQ9H606 182 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ECT2Q9H8V3 914 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IL21Q9HBE4 155 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 VPS18Q9P253 973 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NEU3Q9UQ49 428 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6B-206ENST00000556765 OBSL1O75147 1896 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms