RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 P2RY11Q96G91 374 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 C8orf48Q96LL4 319 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 FOXB1Q99853 325 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 CD93Q9NPY3 652 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 CAPN14A8MX76 684 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM49CP0CI26 452 aa7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 SLC5A3P53794 718 aa7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 ELF2Q15723 593 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 TM4SF20Q53R12 229 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 PMS2CLQ68D20 193 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 RASSF3Q86WH2 238 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM25Q86YD3 366 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 GPR135Q8IZ08 494 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 NUP93Q8N1F7 819 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 SPATA18Q8TC71 538 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 TWNKQ96RR1 684 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 PNKPQ96T60 521 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ACOX2Q99424 681 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 SMOQ99835 787 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 VPS45Q9NRW7 570 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 OSER1Q9NX31 292 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 RAD54BQ9Y620 910 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 ACACBO00763 2458 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 AKAP13Q12802 2813 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A1B0GVL5 298 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A1W2PRX2 142 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 YEATS4O95619 227 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 CD58P19256 250 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 LIMK1P53667 647 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 IRX4P78413 519 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 HECTD3Q5T447 861 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 PAGE5Q96GU1 130 aa7.23□□□□□ -1.25
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GNPTAB-209ENST00000552009 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 NACA2Q9H009 215 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 CUEDC2Q9H467 287 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 NMUR1Q9HB89 426 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 PLK2Q9NYY3 685 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-209ENST00000552009 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.23□□□□□ -1.25
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