RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PRKCGP05129 697 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 UQCRHP07919 91 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 PDHA1P08559 390 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CHRNB1P11230 501 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ITIH2P19823 946 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 DRD1P21728 446 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MAGEA3P43357 314 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CSNK1DP48730 415 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 GEMP55040 296 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ST8SIA6P61647 398 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 AP1S1P61966 158 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MPP3Q13368 585 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 FZD5Q13467 585 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 GALNT3Q14435 633 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MORF4L2Q15014 288 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MYLK3Q32MK0 819 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 WDR93Q6P2C0 686 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 C4orf22Q6V702 233 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 IFT20Q8IY31 132 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CHPFQ8IZ52 775 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SIX5Q8N196 739 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MPP5Q8N3R9 675 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 KDM1BQ8NB78 822 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MSANTD3Q96H12 275 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SERPINB12Q96P63 405 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 FAM129BQ96TA1 746 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CASS4Q9NQ75 786 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 WNT16Q9UBV4 365 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SARDHQ9UL12 918 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CHKBQ9Y259 395 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CKAP5Q14008 2032 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MYLKQ15746 1914 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 A0A0U1RQS6 177 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PQF6 199 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 FZD6O60353 706 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LEFTY1O75610 366 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 UGT2B4P06133 528 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 EPHX1P07099 455 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SERPINF2P08697 491 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 TPH1P17752 444 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 NTSR1P30989 418 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LMAN1P49257 510 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 STARD6P59095 220 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 TUBB4BP68371 445 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CRADDP78560 199 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 PRKCQQ04759 706 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CALCOCO2Q13137 446 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CUL1Q13616 776 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 GAS6Q14393 721 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 PRPSAP1Q14558 356 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SLC1A5Q15758 541 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SLC14A2Q15849 920 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ARSIQ5FYB1 569 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 RANBP10Q6VN20 620 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 HOOK3Q86VS8 718 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 CACUL1Q86Y37 369 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 PLPP6Q8IY26 295 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 MCUQ8NE86 351 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 UCMAQ8WVF2 138 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 RUBCNQ92622 972 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 FEM1CQ96JP0 617 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-216ENST00000549221 GABRG3Q99928 467 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms