RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OSER1Q9NX31 292 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAD54BQ9Y620 910 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HACD1B0YJ81 288 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SGK1O00141 431 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COCHO43405 550 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACSL4O60488 711 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KATNA1O75449 491 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LATS1O95835 1130 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD48P09326 243 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOT1P17174 413 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARSEP51690 589 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BPIFB3P59826 476 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP4F8P98187 520 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DR1Q01658 176 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ID3Q02535 119 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMK1Q14012 370 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLMAPQ14BN4 828 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDK1Q15118 436 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CA9Q16790 459 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUM1Q2TAK8 710 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB6CQ53S08 254 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR158Q5T848 1215 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CES5AQ6NT32 575 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAOXQ6QHF9 649 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C4orf22Q6V702 233 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFX8Q6ZV50 586 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHSY1Q86X52 802 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM71BQ8TC56 605 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf54Q8WWF1 131 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NELL2Q99435 816 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TASP1Q9H6P5 420 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC19Q9H756 370 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HAUS2Q9NVX0 235 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOTCH4Q99466 2003 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf78A6NCI8 922 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRRT4C9JH25 899 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 E9PAM4 449 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFPL2O75678 378 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYBBP04839 570 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHOP08100 348 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM153BP0C7A2 387 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERCC2P18074 760 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TACR2P21452 398 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNCP24863 283 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHKAP35790 457 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PGFP49763 221 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CALCOCO2Q13137 446 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XRCC4Q13426 336 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAZQ16635 292 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP1B1Q16678 543 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TXNDC8Q6A555 127 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.74□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms