RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MLNP12872 115 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRKCHP24723 683 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINA4P29622 427 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ECHS1P30084 290 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADRA1AP35348 466 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPY2RP49146 381 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPHB1P54762 984 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRKCQQ04759 706 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDH17Q12864 832 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAF2Q12933 501 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GALNT3Q14435 633 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IHHQ14623 411 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRM3Q14832 879 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLMAPQ14BN4 828 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC14A2Q15849 920 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIF1AQ16665 826 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARSIQ5FYB1 569 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASC4Q6P4E1 433 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RANBP10Q6VN20 620 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJD3Q8N144 294 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STK40Q8N2I9 435 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPRN2Q92932 1015 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TADA1Q96BN2 335 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RMDN1Q96DB5 314 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYO19Q96H55 970 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHDQ96IW2 340 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FEM1CQ96JP0 617 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINB12Q96P63 405 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM245Q9H330 911 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASS4Q9NQ75 786 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WNT16Q9UBV4 365 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL36AQ9UHA7 158 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HCN2Q9UL51 889 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.59□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC151A5D8V7 595 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALOX15BO15296 676 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOCS5O75159 536 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BANF1O75531 89 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LEFTY1O75610 366 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPP00450 1065 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UGT2B4P06133 528 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDHA1P08559 390 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DPA1P20036 260 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGAT1P26572 445 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NTSR1P30989 418 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELK3P41970 407 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGEA4P43358 317 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHRNA4P43681 627 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PMS2P54278 862 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STARD3Q14849 445 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC1A5Q15758 541 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO43Q4G163 708 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MSS51Q4VC12 460 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EMBQ6PCB8 327 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PALM2Q8IXS6 379 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIX5Q8N196 739 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.58□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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