RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 CACUL1Q86Y37 369 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC89Q8N998 374 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC45Q96CN5 670 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 FCRL5Q96RD9 977 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 CEP41Q9BYV8 373 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 TPSD1Q9BZJ3 242 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 NOD2Q9HC29 1040 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 FBXL12Q9NXK8 326 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ANXA9O76027 345 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 P2RY2P41231 377 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 DSC2Q02487 901 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 SNX1Q13596 522 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 PRPSAP1Q14558 356 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 PAF1Q8N7H5 531 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 FAM71DQ8N9W8 422 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB44Q8NCP5 570 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ATL2Q8NHH9 583 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 ECHDC3Q96DC8 303 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 SLC6A17Q9H1V8 727 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 SGK2Q9HBY8 427 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRK-218ENST00000525459 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 NFKB1P19838 968 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 DRD3P35462 400 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 FNTBP49356 437 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 SLC36A4Q6YBV0 504 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 AADATQ8N5Z0 425 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GANCQ8TET4 914 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF592Q92610 1267 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CDC23Q9UJX2 597 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PP55 124 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PIGNO95427 931 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GAS8O95995 478 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GKP32189 559 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CD86P42081 329 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PXNP49023 591 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 MPP3Q13368 585 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFAF2Q8N183 169 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GAB3Q8WWW8 586 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 VOPP1Q96AW1 172 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 BTBD1Q9H0C5 482 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PCED1AQ9H1Q7 454 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 C10orf88Q9H8K7 445 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PAK5Q9P286 719 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 THADAQ6YHU6 1953 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 ADRB3P13945 408 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CD6P30203 668 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GEMP55040 296 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 GDF10P55107 478 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 SKOR1P84550 965 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PARP6Q2NL67 630 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 ARRDC3Q96B67 414 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 TADA1Q96BN2 335 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CYP8B1Q9UNU6 501 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 AP1G1O43747 822 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 URI1O94763 535 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 CPP00450 1065 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRK-218ENST00000525459 IFNB1P01574 187 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms