RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ACAD9Q9H845 621 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 FNIP2Q9P278 1114 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 KLQ9UEF7 1012 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RCE1Q9Y256 329 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MYOM1P52179 1685 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PTPRTO14522 1441 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MYOM2P54296 1465 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ACTL6BO94805 426 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 AMD1P17707 334 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 YWHAQP27348 245 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SERPINA4P29622 427 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SPATA20Q8TB22 786 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 EID2BQ96D98 161 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CLPBQ9H078 707 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DHDHQ9UQ10 334 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NFS1Q9Y697 457 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CEP152O94986 1710 aa5.03□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 TET3O43151 1660 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 MYO3AQ8NEV4 1616 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 A0A096LPK6 155 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CLGNO14967 610 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 GPR12P47775 334 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 AP2B1P63010 937 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 DLG1Q12959 904 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PICALMQ13492 652 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 DCTN1Q14203 1278 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 XKR9Q5GH70 373 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 STPG1Q5TH74 334 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 NEK10Q6ZWH5 1172 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 BRSK2Q8IWQ3 736 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ZNF114Q8NC26 417 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PLCH2O75038 1416 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 LGALS16A8MUM7 142 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PRAC2D3DTV9 90 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 FFAR2O15552 330 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 STRNO43815 780 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 LMX1BO60663 402 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CH25HO95992 272 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PPM1AP35813 382 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 SRLQ86TD4 932 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 GPT2Q8TD30 523 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 C3orf49Q96BT1 292 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 TMEM51Q9NW97 253 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CDC23Q9UJX2 597 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CLTCL1P53675 1640 aa5.01□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CHL1O00533 1208 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PARNO95453 639 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 AFPP02771 609 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CHN1P15882 459 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 DCTDP32321 178 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 TMF1P82094 1093 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ST3GAL1Q11201 340 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CEP85LQ5SZL2 805 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 PMS2CLQ68D20 193 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 IL31Q6EBC2 164 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 RHBDF2Q6PJF5 856 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 KLHL17Q6TDP4 642 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 C9orf139Q6ZV77 190 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 FAM186BQ8IYM0 893 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 SECTM1Q8WVN6 248 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 UHRF2Q96PU4 802 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 POLR3GLQ9BT43 218 aa5□□□□□ -1.61
SGCE-211ENST00000522045 CHST12Q9NRB3 414 aa5□□□□□ -1.61
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