RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TFAP2BQ92481 460 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ISL2Q96A47 359 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HAUS1Q96CS2 278 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM210AQ96ND0 272 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNF157Q96PX1 679 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KLC2Q9H0B6 622 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RGS18Q9NS28 235 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 VPS28Q9UK41 221 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GINS2Q9Y248 185 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IRAK3Q9Y616 596 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FBN2P35556 2912 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 E5RJQ4 531 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 H3BRJ5 948 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA8RI6L899 631 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DCLK1O15075 740 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GLRA3O75311 464 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BANF1O75531 89 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IL18RAPO95256 599 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SETSIPP0DME0 302 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CHRNB1P11230 501 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 UQCRBP14927 111 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PROZP22891 400 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MIPP30301 263 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GSTT1P30711 240 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SCNN1AP37088 669 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NR2C2P49116 596 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NUMBP49757 651 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SESN3P58005 492 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SP4Q02446 784 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DEUP1Q05D60 604 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 STILQ15468 1287 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CHI3L2Q15782 390 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 USP41Q3LFD5 358 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PLK5Q496M5 336 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAXCQ5TGI0 409 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IER5Q5VY09 327 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MBLAC2Q68D91 279 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BORAQ6PGQ7 559 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TTC7BQ86TV6 843 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PHC3Q8NDX5 983 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM3CQ92520 227 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM167AQ96KS9 214 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ACAP3Q96P50 834 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF670Q9BS34 389 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NAT9Q9BTE0 207 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.32□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.32□□□□□ -1.24
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