RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511145.1

FAM13A-215, Transcript of family with sequence similarity 13 member A, human

TSL 3

Gene FAM13A, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM13A-215	ENST00000511145	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SGK1	O00141	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	HCRT	O43612	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SH3BP5	O60239	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	JAK2	O60674	1132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PFKFB2	O60825	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TOM1L1	O75674	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	GJB3	O75712	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CDKL5	O76039	1030 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PCDH8	O95206	1070 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	NDUFA10	O95299	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	LY86	O95711	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ODC1	P11926	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	XBP1	P17861	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CDC25A	P30304	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CXCR5	P32302	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SEC24C	P53992	1094 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	LMAN2	Q12907	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	MYLK	Q15746	1914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145		H0Y626	953 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PIR	O00625	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CYB561D2	O14569	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CLDN3	O15551	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TRIM16	O95361	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ADRB2	P07550	413 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SERPINF2	P08697	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CLTA	P09496	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	RBP3	P10745	1247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CYP3A5	P20815	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CYP2F1	P24903	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	IFNAR2	P48551	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	NHLH2	Q02577	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CD69	Q07108	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF460	Q14592	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	TAF12	Q16514	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	IL17A	Q16552	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM13A-215	ENST00000511145	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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