RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM47EQ6ZV65 393 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PALM2Q8IXS6 379 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB106AQ8N104 65 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FITM2Q8N6M3 262 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 EMC1Q8N766 993 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCTD6Q8NC69 237 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPT1BQ92523 772 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO32Q969P5 355 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIFAQ96CG3 184 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHL29Q96CT2 875 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RMDN2Q96LZ7 410 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GCNAQ96QF7 691 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NACA2Q9H009 215 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TLE6Q9H808 572 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX16Q9P0S2 106 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCSK1NQ9UHG2 260 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GGT7Q9UJ14 662 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCML2Q9UQR0 700 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 USH1CQ9Y6N9 552 aa5.7□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SZT2Q5T011 3432 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIEZO1Q92508 2521 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PPM1 405 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIDE1A8MVS5 230 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HHLA1C9JL84 531 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 E7ENQ6 273 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0QYT0 321 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TM9SF1O15321 606 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAM12O43184 909 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TYROBPO43914 113 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BANF1O75531 89 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DAB1O75553 588 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPAG6O75602 509 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOAT2O75908 522 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ENDOD1O94919 500 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC24AO95486 1093 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGF19O95750 216 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOC2P02655 101 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC2A3P11169 496 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCNB1P14635 433 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPN2P17706 415 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL1R2P27930 398 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MIPP30301 263 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCK1P35558 622 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MSH2P43246 934 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPN9P43378 593 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SULT1E1P49888 294 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CACNA2D1P54289 1103 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ2P63252 427 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEUP1Q05D60 604 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MGAT5Q09328 741 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TWF1Q12792 350 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF10Q12962 218 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC3Q13217 504 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NME3Q13232 169 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT81Q14533 505 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOMO1Q15155 1222 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF5Q15542 800 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC1A5Q15758 541 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BBS9Q3SYG4 887 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC14Q49A88 953 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms