RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 AMACRQ9UHK6 382 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 COL4A2P08572 1712 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RNF103O00237 685 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CBX4O00257 560 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KDELR3O43731 214 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PRAMEF11O60813 436 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TULP3O75386 442 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 IFNB1P01574 187 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 APODP05090 189 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CELA3AP09093 270 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SRFP11831 508 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GLULP15104 373 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MCM3P25205 808 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 HLA-FP30511 346 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 NNMTP40261 264 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TFF2Q03403 129 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TNK2Q07912 1038 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TDGQ13569 410 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PTK6Q13882 451 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TEX35Q5T0J7 233 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 JAMLQ86YT9 394 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RTP4Q96DX8 246 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 P2RY11Q96G91 374 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 LGMNQ99538 433 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SPON2Q9BUD6 331 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KLC2Q9H0B6 622 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PAK5Q9P286 719 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0A0MRY4 1105 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ARNTLO00327 626 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MATN3O15232 486 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MAFKO60675 156 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CCNB1P14635 433 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 VAV1P15498 845 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RBL1P28749 1068 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CD70P32970 193 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GJA4P35212 333 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ACVRL1P37023 503 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MMP13P45452 471 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PLK1P53350 603 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ST8SIA6P61647 398 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ZP2Q05996 745 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 KDSRQ06136 332 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SLC20A2Q08357 652 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FUT11Q495W5 492 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 ARTNQ5T4W7 220 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 MARC1Q5VT66 337 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TERB1Q8NA31 727 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 BBOF1Q8ND07 529 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 OR7D4Q8NG98 312 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 UBXN4Q92575 508 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA13Q96N96 652 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PNKPQ96T60 521 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 VPS51Q9UID3 782 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 GGT7Q9UJ14 662 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-211ENST00000497210 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms