RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 TMTC1Q8IUR5 882 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 MFSD2AQ8NA29 543 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 FAF2Q96CS3 445 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC17A9Q9BYT1 436 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC32A1Q9H598 525 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SUV39H2Q9H5I1 410 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 FZD3Q9NPG1 666 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 DKK3Q9UBP4 350 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SEPT3Q9UH03 358 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 HYOU1Q9Y4L1 999 aa17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SH3BP5O60239 455 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 NXPH1P58417 271 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PQLC3Q8N755 202 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 HCAR2Q8TDS4 363 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PSKH2Q96QS6 385 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRD1A4D1F6 860 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 IGLON5A6NGN9 336 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 AREL1O15033 823 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFA10O95299 355 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 MAP3K6O95382 1288 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 TNNT1P13805 278 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 COMTP21964 271 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 AKT2P31751 481 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC1A1P43005 524 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SCNN1BP51168 640 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 RENBPP51606 427 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 HADHBP55084 474 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 IL9RQ01113 521 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 GALNT2Q10471 571 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 FGL2Q14314 439 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF235Q14590 738 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 IQCHQ86VS3 1027 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC49Q8IUZ0 686 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 NAXDQ8IW45 347 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PGBD5Q8N414 524 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 NSMCE1Q8WV22 266 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 NSMCE3Q96MG7 304 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF157Q96PX1 679 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 GDF3Q9NR23 364 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 NCOR2Q9Y618 2525 aa17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 TSPAN11A1L157 253 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SPOPO43791 374 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 DFNA5O60443 496 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ADRB1P08588 477 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 XPAP23025 273 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SERPINA4P29622 427 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 CDC25BP30305 580 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 GARSP41250 739 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 CLDN2P57739 230 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 GBE1Q04446 702 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 BCL2L1Q07817 233 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 OVGP1Q12889 678 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP58Q5T655 872 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 MARC1Q5VT66 337 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC38Q5VT99 294 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 RHOT1Q8IXI2 618 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SPC24Q8NBT2 197 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ALG6Q9Y672 507 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 PCNX2A6NKB5 2137 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1B0GTQ1 180 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 RCCD1A6NED2 376 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF487B1APH4 448 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 RAD51BO15315 384 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGEC1O60732 1142 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 MMP20O60882 483 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 KRT1P04264 644 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 THEGLP0DJG4 465 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 MMP13P45452 471 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 CCT8P50990 548 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SUOXP51687 545 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 AP1S1P61966 158 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM193AP78312 1265 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SGCGQ13326 291 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-205ENST00000496887 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms