RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 PLD1Q13393 1074 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 NFYCQ13952 458 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SPA17Q15506 151 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TBR1Q16650 682 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 RNF151Q2KHN1 245 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 AGBL4Q5VU57 503 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TAF3Q5VWG9 929 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 VPS36Q86VN1 386 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TMC8Q8IU68 726 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 UBA3Q8TBC4 463 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 PSMG2Q969U7 264 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SPATA17Q96L03 361 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 DUSP16Q9BY84 665 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ISCUQ9H1K1 167 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 THEGQ9P2T0 379 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TFR2Q9UP52 801 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 VWA7Q9Y334 891 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ASB3Q9Y575 518 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ATP8B3O60423 1300 aa7.16□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 A0A0A6YYJ9 748 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 M0QYV0 167 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CCP110O43303 1012 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 THAP12O43422 761 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 BRINP1O60477 761 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 RTN2O75298 545 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 RHOP08100 348 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CCDC175P0C221 793 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 PTPN2P17706 415 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 MTHFRP42898 656 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 GPD2P43304 727 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 PDE6CP51160 858 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 VAV2P52735 878 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 GALCP54803 685 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 VEPH1Q14D04 833 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CES5AQ6NT32 575 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 PIGZQ86VD9 579 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ITFG1Q8TB96 612 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.15□□□□□ -1.26
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TPR-208ENST00000492973 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 OR10A2Q9H208 303 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 MTG2Q9H4K7 406 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 POMKQ9H5K3 350 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 IL37Q9NZH6 218 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 INTUQ9ULD6 942 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 CLUHO75153 1309 aa7.15□□□□□ -1.26
TPR-208ENST00000492973 FAM92AA1XBS5 289 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MED7O43513 233 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 APOL3O95236 402 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 H2AFZP0C0S5 128 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 SETSIPP0DME0 302 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CSH1P0DML2 217 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CSH2P0DML3 217 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MYL4P12829 197 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 IL9P15248 144 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 GJA1P17302 382 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CEBPBP17676 345 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 PGFP49763 221 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 RGS7P49802 495 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 MEOX1P50221 254 aa7.14□□□□□ -1.27
TPR-208ENST00000492973 SLC5A3P53794 718 aa7.14□□□□□ -1.27
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