RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	L1CAM	P32004	1257 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	CCKBR	P32239	447 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	GGCX	P38435	758 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	CASR	P41180	1078 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	YPEL5	P62699	121 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	FOXK1	P85037	733 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	APBA1	Q02410	837 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	AMZ1	Q400G9	498 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	VWA3B	Q502W6	1294 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	CARD16	Q5EG05	197 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	MACC1	Q6ZN28	852 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	DEFB106A	Q8N104	65 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	KY	Q8NBH2	561 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	TBATA	Q96M53	351 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	CATSPER2	Q96P56	530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	WDCP	Q9H6R7	721 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	SIX2	Q9NPC8	291 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM51	Q9NW97	253 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	RRN3	Q9NYV6	651 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	KL	Q9UEF7	1012 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM131	Q92545	1883 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM107B-223	ENST00000489100	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100		B4DGG1	531 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	C10orf142	B7Z368	130 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TOR1B	O14657	336 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	RAD51B	O15315	384 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	AP1G1	O43747	822 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	NOBOX	O60393	691 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	SRGAP2	O75044	1071 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	VPS4B	O75351	444 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	PAGE1	O75459	146 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	GRAP2	O75791	330 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TM7SF2	O76062	418 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	ERBB2	P04626	1255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TPM2	P07951	284 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	MAN1A1	P33908	653 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	CLCN1	P35523	988 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	SCNN1A	P37088	669 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	ETFB	P38117	255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC6A3	Q01959	620 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	RAD51	Q06609	339 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC20A2	Q08357	652 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TAF5	Q15542	800 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	MIIP	Q5JXC2	388 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TTC7B	Q86TV6	843 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	PIM3	Q86V86	326 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM107B-223	ENST00000489100	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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