RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CKMT1AP12532 417 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 GNLYP22749 145 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CLCN5P51795 746 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MVDP53602 400 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 PRKG1Q13976 671 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CASC1Q6TDU7 716 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM74Q86UV6 250 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM73Q86UV7 250 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TMC8Q8IU68 726 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 GHDCQ8N2G8 530 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 LINS1Q8NG48 757 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 AFG1LQ8WV93 481 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TMED6Q8WW62 240 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 NCSTNQ92542 709 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM18Q96B42 140 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 PTPN23Q9H3S7 1636 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FMN1Q68DA7 1419 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RAD50Q92878 1312 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1B0GUL7 405 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01553A4QN01 128 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TNNT1P13805 278 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR12P47775 334 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 AMTP48728 403 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC91Q7Z6B0 441 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MYCT1Q8N699 235 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MNS1Q8NEH6 495 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 LMO3Q8TAP4 145 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM163Q8TC26 289 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 THAP4Q8WY91 577 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TSPY26PQ9H489 355 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 POLKQ9UBT6 870 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SUFUQ9UMX1 484 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MIA2Q96PC5 1412 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MTUS2Q5JR59 1369 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 DENND3A2RUS2 1198 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 IFITM10A6NMD0 228 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SMTNL1A8MU46 457 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 BTBD18B2RXH4 712 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPINI2O75830 405 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RXRAP19793 462 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGB8P26012 769 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 GJC1P36383 396 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 MTNR1AP48039 350 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 PDLIM4P50479 330 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC39A14Q15043 492 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC96Q2M329 555 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 DLK2Q6UY11 383 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT10Q6XYQ8 523 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RTP4Q96DX8 246 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TXNDC15Q96J42 360 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO40Q9UH90 709 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 HFM1A2PYH4 1435 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CGNL1Q0VF96 1302 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms