RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484403.5

CCT8-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 8, human

TSL 3

Gene CCT8, Length 808 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT8-208	ENST00000484403	KDM4B	O94953	1096 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	AMBP	P02760	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	ACP5	P13686	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	NLRP5	P59047	1200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	TRIB2	Q92519	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	EID2B	Q96D98	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403		A0A1B0GU03	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	CLDN14	O95500	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	LPIN1	Q14693	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	ALF	Q53S48	1182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT8-208	ENST00000484403	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	BDNF	P23560	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	SERPINA4	P29622	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	TIMP3	P35625	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	BIRC3	Q13489	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	CAPS	Q13938	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	TRIM14	Q14142	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	EDIL3	O43854	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	SLC22A3	O75751	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GAGE7	O76087	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	ACTL6B	O94805	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	CBX6	O95503	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	FGF5	P12034	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	KCNA5	P22460	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	MYF6	P23409	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	PTPN9	P43378	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	MTNR1A	P48039	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	MVD	P53602	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GAGE1	Q13065	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GAGE4	Q13068	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	RPE65	Q16518	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT8-208	ENST00000484403	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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