RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TCF12Q99081 682 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RHOJQ9H4E5 214 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.375e-6■■■■□ 20.3
PRKCI-202ENST00000476635 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MSRAQ9UJ68 235 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1W2PRU2 124 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TARM1B6A8C7 271 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CCL16O15467 120 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TIMM44O43615 452 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 KRT38O76015 456 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TMCC1O94876 653 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CSKP41240 450 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 HYAL1Q12794 435 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 UGP2Q16851 508 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FUT11Q495W5 492 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CALML6Q8TD86 181 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CDKL2Q92772 493 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SMOXQ9NWM0 555 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 KRT37O76014 449 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PGLSO95336 258 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FAM107AO95990 144 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINF2P08697 491 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PAMP19021 973 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 DRD4P21917 467 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 AGERQ15109 404 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 GPR153Q6NV75 609 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PLLPQ9Y342 182 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CENPFP49454 3210 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MYOGP15173 224 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CHN1P15882 459 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CDR1P51861 262 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 HK2P52789 917 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 DSC2Q02487 901 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FAXCQ5TGI0 409 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RETSATQ6NUM9 610 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC25Q86WR0 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 TDHQ8IZJ6 230 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 OR7D4Q8NG98 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SMARCD2Q92925 531 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MSANTD3Q96H12 275 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SERAC1Q96JX3 654 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 AGAP3Q96P47 875 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 FICDQ9BVA6 458 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 MAP3K6O95382 1288 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 PRAMEF12O95522 483 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 KRT15P19012 456 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 RGRP47804 291 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB8P50452 374 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 NAA20P61599 178 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 NFKB2Q00653 900 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKCI-202ENST00000476635 ITIH4Q14624 930 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms