RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.13□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.13□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 A6NNZ2 444 aa7.12□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 AP2A1O95782 977 aa7.11□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 NUDT17P0C025 328 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 GJA1P17302 382 aa7.11□□□□□ -1.27
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