RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CHRNA1	P02708	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	THRA	P10827	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC2A3	P11169	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	COX4I1	P13073	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CYBA	P13498	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCR1	P32246	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC26A3	P40879	764 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAPK9	P45984	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SCNN1G	P51170	649 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	NDST2	P52849	883 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	NKD1	Q969G9	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	VCX	Q9H320	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TREX1	Q9NSU2	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MATN2	O00339	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	HDAC3	O15379	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAFK	O60675	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	KIT	P10721	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	NMBR	P28336	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARRB2	P32121	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAGEA11	P43364	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CLCN5	P51795	746 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	POU4F1	Q01851	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GRM3	Q14832	879 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PEX13	Q92968	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490		H0Y3Z8	333 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ITGAX	P20702	1163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CD151	P48509	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RAB10	P61026	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MXRA7	P84157	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	KDSR	Q06136	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSMD5	Q16401	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCL14	Q16627	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PTPRN	Q16849	979 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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