RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437840.6

RGL2-238, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 2, human

TSL 1 (best)

Gene RGL2, Length 2,687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL2-238	ENST00000437840	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	AK5	Q9Y6K8	562 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC160	A6NGH7	325 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ATP6V1G1	O75348	118 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	AXL	P30530	894 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PPIL2	Q13356	520 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	IKBKE	Q14164	716 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	POU6F1	Q14863	301 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CARM1	Q86X55	608 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MED10	Q9BTT4	135 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CD300A	Q9UGN4	299 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NEMP2	A6NFY4	417 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840		H3BSA7	217 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	USP17L7	P0C7H9	530 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ARSA	P15289	507 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SMPD1	P17405	629 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LRPAP1	P30533	357 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SLC1A2	P43004	574 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	USP46	P62068	366 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	STX5	Q13190	355 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NRF1	Q16656	503 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SULF1	Q8IWU6	871 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	WDCP	Q9H6R7	721 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NEU3	Q9UQ49	428 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CDK4	P11802	303 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	C1QTNF8	P60827	252 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NUP93	Q8N1F7	819 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	USP33	Q8TEY7	942 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SGF29	Q96ES7	293 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FCRL5	Q96RD9	977 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RRN3	Q9NYV6	651 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840		A0A087X1B8	175 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	F9	P00740	461 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF23	P17027	643 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KCNA5	P22460	613 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HPCA	P84074	193 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SQLE	Q14534	574 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	REP15	Q6BDI9	236 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FAM35A	Q86V20	835 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LPGAT1	Q92604	370 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TREX1	Q9NSU2	369 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MRGBP	Q9NV56	204 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HHLA1	C9JL84	531 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TRPA1	O75762	1119 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HDC	P19113	662 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ADRA1A	P35348	466 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF280D	Q6N043	979 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FAR2	Q96K12	515 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SLC29A1	Q99808	456 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GALNT8	Q9NY28	637 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		14.9	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms