RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNPOQ9NVS9 261 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPP3Q9NY33 737 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP72Q9P209 647 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 L1RE1Q9UN81 338 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTBN2O15020 2390 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PI4KAP42356 2102 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GVL5 298 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANO9A1A5B4 782 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6C75A6NL08 312 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANHXE9PGG2 379 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BUI4 141 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PJA2O43164 708 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX33O43247 280 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXTL3O43909 919 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D4O60343 1298 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP6R2O75170 966 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL18RAPO95256 599 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HRGP04196 525 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYL1P05976 194 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 INHBBP09529 407 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLULP15104 373 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP3A5P20815 502 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRR2P28476 465 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDI1P31150 447 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXD13P35453 343 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASP4P49662 377 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALCAMQ13740 583 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGPT1Q15389 498 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB6Q15916 424 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF12Q16514 161 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KYAT1Q16773 422 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 RESP18Q5W5W9 173 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPGS2Q68CL5 300 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 VITQ6UXI7 678 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOK3Q7L591 496 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL23Q86XA0 190 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC8Q8IU68 726 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR65Q8IYL9 337 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYLPFQ96A32 169 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC17Q96AE7 1141 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 RSPRY1Q96DX4 576 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCNAQ96QF7 691 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDC1Q9BTX1 674 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRD9Q9H8M2 597 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPC7Q9HCX4 862 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIX4Q9UIU6 781 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2CD2Q9Y426 696 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 R4GN57 208 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM131Q92545 1883 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE4BO95155 1302 aa4.7□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa4.69□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.69□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPN8A6NHC0 703 aa4.69□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.69□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 KPNA7A9QM74 516 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms