RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 UGP2Q16851 508 aa23.41■■□□□ 1.34
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.41■■□□□ 1.34
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FAAP20-209ENST00000428120 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PACS2Q86VP3 889 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CEP97Q8IW35 865 aa23.4■■□□□ 1.34
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FAAP20-209ENST00000428120 HS6ST3Q8IZP7 471 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.39■■□□□ 1.34
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FAAP20-209ENST00000428120 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MGME1Q9BQP7 344 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
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FAAP20-209ENST00000428120 ARL5AQ9Y689 179 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TBL1XO60907 577 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 BAIAP3O94812 1187 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35E2BP0CK96 405 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ2P63252 427 aa23.39■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 CCDC153Q494R4 210 aa23.39■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 GAREM2Q75VX8 874 aa23.39■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.39■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 RANBP9Q96S59 729 aa23.39■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TASP1Q9H6P5 420 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 IL23AQ9NPF7 189 aa23.39■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.331e-7■□□□□ 9
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FAAP20-209ENST00000428120 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 MROH6A6NGR9 719 aa23.38■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 LINC00271P0C7V0 271 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 GJA1P17302 382 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CD151P48509 253 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ATG14Q6ZNE5 492 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ITIH5Q86UX2 942 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.38■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.38■■□□□ 1.33
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FAAP20-209ENST00000428120 LDB2O43679 373 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SIN3BO75182 1162 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CTSAP10619 480 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 ARRB2P32121 409 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SLC1A6P48664 564 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 CNPY4Q8N129 248 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL29Q96CT2 875 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 H0Y626 953 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 TK2O00142 265 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-209ENST00000428120 GREM1O60565 184 aa23.37■■□□□ 1.33
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