RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 BNIPLQ7Z465 357 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SERINC5Q86VE9 423 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ING5Q8WYH8 240 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 THAP2Q9H0W7 228 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NT5MQ9NPB1 228 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RGS18Q9NS28 235 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 DZANK1Q9NVP4 752 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.73e-6■■■■□ 26.3
ANKRD28-202ENST00000412318 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NR2E1Q9Y466 385 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RGPD2P0DJD1 1756 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 AIM2O14862 343 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CLOCKO15516 846 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SULT1B1O43704 296 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TBL1XO60907 577 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SIN3BO75182 1162 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SNAPC5O75971 98 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SEC24AO95486 1093 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CRTAMO95727 393 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPIND1P05546 499 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RB1P06400 928 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CCNA2P20248 432 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CHRM3P20309 590 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FSHRP23945 695 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-202ENST00000412318 MAPK8P45983 427 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PFKPQ01813 784 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAF2Q12933 501 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SMCO1Q147U7 214 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 OCLNQ16625 522 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NFIL3Q16649 462 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf189Q5VU69 101 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR153Q6NV75 609 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PLET1Q6UQ28 207 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 DPP10Q8N608 796 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-202ENST00000412318 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR152Q8TDT2 470 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX27Q96L92 541 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC115Q96NT0 180 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZIC5Q96T25 663 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FICDQ9BVA6 458 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP50Q9UKX7 468 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 OR14I1A6ND48 311 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ENPP3O14638 875 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 IL1BP01584 269 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PBX3P40426 434 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 NRG3P56975 720 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 LILRA4P59901 499 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 AP1S1P61966 158 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 HSF2Q03933 536 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SULT2A1Q06520 285 aa4.45□□□□□ -1.7
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ANKRD28-202ENST00000412318 PTK6Q13882 451 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCL1Q15111 1095 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNEQ86WN2 208 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF135Q8IUD6 432 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-202ENST00000412318 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
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