RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401008.6

PDZK1P1-201, Transcript of PDZ domain containing 1 pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDZK1P1, Length 3,498 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1-201ENST00000401008 DDI1Q8WTU0 396 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDZK1P1-201ENST00000401008 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.55□□□□□ -1.2
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