RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PGM2Q96G03 612 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ZBTB14O43829 449 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GLUD1P00367 558 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 HSMCR30P0CW71 290 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GLUD2P49448 558 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 LRRC38Q5VT99 294 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 SPACA7Q96KW9 195 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 OR51F1A6NGY5 319 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GMFGO60234 142 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ADH1AP07327 375 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 MPSTP25325 297 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ALFQ53S48 1182 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PACS1Q6VY07 963 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 VCLP18206 1134 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ACLYP53396 1101 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 RAB10P61026 200 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ADCK1Q86TW2 530 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ITPKAP23677 461 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 OR4L1Q8NH43 312 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 FZD8Q9H461 694 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NACC2Q96BF6 587 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NXNL1Q96CM4 212 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 TLE6Q9H808 572 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 LRPAP1P30533 357 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CHRNB3Q05901 458 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PACS2Q86VP3 889 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 OR10G6Q8NH81 332 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 THAP11Q96EK4 314 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NPAS2Q99743 824 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 RMND5AQ9H871 391 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ARL5AQ9Y689 179 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 A0A087X1B8 175 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 H0Y858 1186 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 TP73O15350 636 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GRK3P35626 688 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CYP4F2P78329 520 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CDK18Q07002 472 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PLD3Q8IV08 490 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 TMEM209Q96SK2 561 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PCYT2Q99447 389 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NMUR1Q9HB89 426 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PER2O15055 1255 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 TNNI3P19429 210 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 USE1Q9NZ43 259 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 ZNF711Q9Y462 761 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 TIMM22Q9Y584 194 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 MYH1P12882 1939 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 RPTORQ8N122 1335 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CNTN1Q12860 1018 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 DLG2Q15700 870 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 MTSS1LQ765P7 747 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 GLOD4Q9HC38 313 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CROTQ9UKG9 612 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 NRP1O14786 923 aa14.67□□□□□ -0.06
PSME4-201ENST00000389993 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms