RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT6Q8NCL4 622 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF248Q8NDW4 579 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HEXDCQ8WVB3 486 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 NELL1Q92832 810 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 EBF3Q9H4W6 596 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DPP7Q9UHL4 492 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB23Q9ULC3 237 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.71□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PSME3P61289 254 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ITCHQ96J02 903 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TBX20Q9UMR3 447 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP12Q02952 1782 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXA2O43364 376 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PLOD3O60568 738 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 VDRP11473 427 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 AQP4P55087 323 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RHEBQ15382 184 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SMYD1Q8NB12 490 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM32Q8TC27 787 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 GPRASP2Q96D09 838 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RGS10O43665 173 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST1H2ABP04908 130 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 FGRP09769 529 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.74e-8■■■■□ 23.1
SH3BP2-201ENST00000356331 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC47A2Q86VL8 602 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM192Q8IY95 271 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST1H2ACQ93077 130 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF38Q9H0F5 515 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RASSF1Q9NS23 344 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RRM1P23921 792 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNCP24863 283 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TPTEP56180 551 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 OAFQ86UD1 273 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HPDLQ96IR7 371 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PDCD5O14737 125 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TFECO14948 347 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 AIREO43918 545 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 BMPR2Q13873 1038 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 C14orf105Q9NVL8 296 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIP11Q15643 1979 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SGPL1O95470 568 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL18O95568 372 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 NAMPTP43490 491 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 LHX1P48742 406 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 MYBPC3Q14896 1274 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ACAT2Q9BWD1 397 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A4Q9H015 551 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH22Q9UJ99 828 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM139Q8IV31 216 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CNTD1Q8N815 330 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 FAXDC2Q96IV6 333 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC18Q9H819 358 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTR8Q9H981 624 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SETD4Q9NVD3 440 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKG2Q13237 762 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 FAAH2Q6GMR7 532 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR49Q8IV35 697 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS4AQ9UN37 437 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNB1P14635 433 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A3P33764 101 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 LIPMQ5VYY2 423 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC5A5Q92911 643 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ITPKCQ96DU7 683 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 C19orf81C9J6K1 198 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PLOD2O00469 737 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 KMOO15229 486 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PDIA6Q15084 440 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms