RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FAM84AQ96KN4 292 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf50Q9BV19 199 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CXCR2P25025 360 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A3Q00325 362 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CERS5Q8N5B7 392 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 PSME2Q9UL46 239 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FTH1P02794 183 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CHPFQ8IZ52 775 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FKTNO75072 461 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 MARCKSL1P49006 195 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEC1O60732 1142 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 OR52L1Q8NGH7 329 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ENKURQ8TC29 256 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2E3Q969T4 207 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 RHBDL3P58872 404 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 IL17AQ16552 155 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ATL1Q8WXF7 558 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 MED26O95402 600 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 PSEN1P49768 467 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 RAB10P61026 200 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 CCNIQ14094 377 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 MC4RP32245 332 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 C21orf59P57076 290 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 FBXL16Q8N461 479 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB118Q96PH6 123 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 INHBEP58166 350 aa22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MIIPQ5JXC2 388 aa22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 IL6P05231 212 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 DIABLOQ9NR28 239 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRM-201ENST00000332175 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TNS4Q8IZW8 715 aa22.51■■□□□ 1.19
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