RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC6Q86X45 466 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ALLCQ8N6M5 410 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PANX3Q96QZ0 392 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ATP9BO43861 1147 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A4P31645 630 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC11A2P49281 568 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 KLC3Q6P597 504 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 IGSF8Q969P0 613 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CATSPER2Q96P56 530 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SZT2Q5T011 3432 aa20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 LINC01565O15544 149 aa20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PGM3O95394 542 aa20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TACR2P21452 398 aa20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CLUHO75153 1309 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 H7C0C1 242 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 GREM1O60565 184 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PFKLP17858 780 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ATP5OP48047 213 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 GDF10P55107 478 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CBX3Q13185 183 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 KRT72Q14CN4 511 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.889e-7■■□□□ 13.8
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO27Q8NI29 283 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC160A6NGH7 325 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ALOX15BO15296 676 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.888e-7■■□□□ 12.2
UBE2B-201ENST00000265339 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 GAD2Q05329 585 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 KLC2Q9H0B6 622 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TASP1Q9H6P5 420 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 SGK1O00141 431 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 FCHO1O14526 889 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEC1O60732 1142 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC6O75061 913 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CEBPBP17676 345 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MPP3Q13368 585 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MORF4L2Q15014 288 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ALFQ53S48 1182 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CENPUQ71F23 418 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ING5Q8WYH8 240 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 THTPAQ9BU02 230 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 F5H5T6 163 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CNTN5O94779 1100 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 GPX6P59796 221 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MTM1Q13496 603 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 POTEHQ6S545 545 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZNB5 142 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 LGI2Q8N0V4 545 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 EFHBQ8N7U6 833 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TTC16Q8NEE8 873 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 APOL5Q9BWW9 433 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 KCNK13Q9HB14 408 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB6P35237 376 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 GALK1P51570 392 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PDSS2Q86YH6 399 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms