RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000000442.10

ESRRA-201, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ESRRA, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-201ENST00000000442 RANBP10Q6VN20 620 aa26.78■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 ARPINQ7Z6K5 226 aa26.78■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 RAB26Q9ULW5 256 aa26.78■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 CPB1P15086 417 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 KIAA0408Q6ZU52 694 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 METTL23Q86XA0 190 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 ADCY4Q8NFM4 1077 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 MRGPRX2Q96LB1 330 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 CHST12Q9NRB3 414 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 CCR1P32246 355 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 PELI3Q8N2H9 469 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 RNF148Q8N7C7 305 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 SGF29Q96ES7 293 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 MRGBPQ9NV56 204 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 Q9Y3F1 56 aa26.77■■□□□ 1.88
ESRRA-201ENST00000000442 DNAJA2O60884 412 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PURAQ00577 322 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SEPT6Q14141 434 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 NEPROQ6NW34 567 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 TICAM1Q8IUC6 712 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 FAR2Q96K12 515 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 NPAS2Q99743 824 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 NDFIP2Q9NV92 336 aa26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 FAM83EQ2M2I3 478 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CNSTQ6PJW8 725 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CCDC126Q96EE4 140 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PKMYT1Q99640 499 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 BPTFQ12830 3046 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 ACOT8O14734 319 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CHRNA4P43681 627 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SULT2A1Q06520 285 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CSHL1Q14406 222 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 TECRLQ5HYJ1 363 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 ARTNQ5T4W7 220 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 ATXN3LQ9H3M9 355 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CYP11A1P05108 521 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 AFMIDQ63HM1 303 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CHSY3Q70JA7 882 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 LILRA2Q8N149 483 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PATJQ8NI35 1801 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PTPRDP23468 1912 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 NEMP2A6NFY4 417 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 TRIM38O00635 465 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PMLP29590 882 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PFKPQ01813 784 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PTK2BQ14289 1009 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 AGAP9Q5VTM2 703 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 ARMC3Q5W041 872 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 KDELC2Q7Z4H8 507 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 LRRC49Q8IUZ0 686 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa26.74■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 AURKAO14965 403 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 B3GAT3O94766 335 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CAPNS1P04632 268 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CALML6Q8TD86 181 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 NDUFA13Q9P0J0 144 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 MSI1O43347 362 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CRTAMO95727 393 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 BRCC3P46736 316 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PSMD5Q16401 504 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 CCL14Q16627 93 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 AP1ARQ63HQ0 302 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 GK5Q6ZS86 529 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 VCX3AQ9NNX9 186 aa26.73■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 HEATR9A2RTY3 570 aa26.72■■□□□ 1.87
ESRRA-201ENST00000000442 IPO13O94829 963 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms