RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 RAXQ9Y2V3 346 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 CACNA1EQ15878 2313 aa7.4□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 GON4LQ3T8J9 2241 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 A0A1B0GTW7 788 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 BLACEA4D250 179 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 MEI4A8MW99 385 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 IRAK2O43187 625 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CBFA2T3O75081 653 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 IGLV3-25P01717 112 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 GLB1P16278 677 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 ZNF445P59923 1031 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 MPP7Q5T2T1 576 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NXNQ6DKJ4 435 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 LAYNQ6UX15 382 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TAC4Q86UU9 113 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NAXDQ8IW45 347 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 KCT2Q8NC54 265 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 HSFY1Q96LI6 401 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 LHX5Q9H2C1 402 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SLC32A1Q9H598 525 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 A0A1B0GVT2 93 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 E5RJQ4 531 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TAF4O00268 1085 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NEMP1O14524 444 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TIMM44O43615 452 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 DLX3O60479 287 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 FBXO21O94952 628 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 KCNH1O95259 989 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 IGLV1-40P01703 118 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 IGHV4-34P06331 123 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SYPP08247 313 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SLC9A1P19634 815 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CD247P20963 164 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 PPP1R2P41236 205 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NUMBP49757 651 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 IRAK1P51617 712 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 PAK1Q13153 545 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SLC14A1Q13336 389 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 STIM1Q13586 685 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 STILQ15468 1287 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TAF5Q15542 800 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 C4orf46Q504U0 113 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 DCAF6Q58WW2 860 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 MFN1Q8IWA4 741 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 APCDD1Q8J025 514 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 OR52K2Q8NGK3 314 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 FIBINQ8TAL6 211 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 AZIN2Q96A70 460 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 TTC17Q96AE7 1141 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 BIRC7Q96CA5 298 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 NUP58Q9BVL2 599 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-211ENST00000641106 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms