RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 AMPD1P23109 780 aa21.88■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 BEND5Q7L4P6 421 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 ADAM32Q8TC27 787 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 DDI1Q8WTU0 396 aa21.88■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 MARK1Q9P0L2 795 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 TAC1P20366 129 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 SLC11A2P49281 568 aa21.88■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 CDK16Q00536 496 aa21.88■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.88■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 RAD54BQ9Y620 910 aa21.88■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 C1QAP02745 245 aa21.87■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.87■■□□□ 1.099e-7■■□□□ 13.8
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SGMS1-210ENST00000619438 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.87■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 A0A0A0MRY4 1105 aa21.86■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.86■■□□□ 1.09
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SGMS1-210ENST00000619438 CA4P22748 312 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 FOXN2P32314 431 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 MPPE1Q53F39 396 aa21.85■■□□□ 1.09
SGMS1-210ENST00000619438 CYS1Q717R9 158 aa21.85■■□□□ 1.09
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